Для того чтобы система работала наилучшим образом нужно, чтобы были настроены под данное железо Mysql и Jboss, диски и файловая система были быстрыми, с сетью не было проблем.
Сейчас мы будем рассматривать только настройки Jboss и MySQL. 
В идеальном мире под сервер приложений и баз данных выделяют отдельные машины, и на каждой машине серверу отдают все ресурсы. 
Но у нас все не так, поэтому будем считать что половину свободной оперативной памяти мы отдадим JBoss-у и вторую половину MySQL. Точнее, от всей оперативной памяти отнимем то, что 
необходимо под ОС и прочие приложения,а остальное поделим пополам.



Сама настройка:

В примерах ниже будем считать, что мы можем отдать 4гБ серверу приложений и столько же мускулу.

1) Увеличиваем память для jboss. Эти изменения вносятся в файл /opt/synergy/jboss/standalone/bin/standalone.conf

Находим вот такое:

if [ "x$JAVA_OPTS" = "x" ]; then
   JAVA_OPTS="-Xms64m -Xmx512m -XX:MaxPermSize=256m -Djava.net.preferIPv4Stack=true -Dorg.jboss.resolver.warning=true -Dsun.rmi.dgc.client.gcInterval=3600000 -Dsun.rmi.dgc.server.gcInterval=3600000"
   JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djboss.modules.system.pkgs=$JBOSS_MODULES_SYSTEM_PKGS -Djava.awt.headless=true"
   JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djboss.server.default.config=standalone.xml"
else
   echo "JAVA_OPTS already set in environment; overriding default settings with values: $JAVA_OPTS"
fi


И меняем цифры:
	Xms64m -> Xms1024m		память, которая будет занята при загрузке
	Xmx512m -> Xmx4096m 		максимальный объем памяти, который сможет использовать ява машина

Получаем:
if [ "x$JAVA_OPTS" = "x" ]; then
   JAVA_OPTS="-Xms1024m -Xmx4096m -XX:MaxPermSize=256m -Djava.net.preferIPv4Stack=true -Dorg.jboss.resolver.warning=true -Dsun.rmi.dgc.client.gcInterval=3600000 -Dsun.rmi.dgc.server.gcInterval=3600000"
   JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djboss.modules.system.pkgs=$JBOSS_MODULES_SYSTEM_PKGS -Djava.awt.headless=true"
   JAVA_OPTS="$JAVA_OPTS -Djboss.server.default.config=standalone.xml"
else
   echo "JAVA_OPTS already set in environment; overriding default settings with values: $JAVA_OPTS"
fi

Чтобы настройки вступили в силу надо перезапустить Jboss

2) Настраиваем Mysql.

Настройки mysql находятся в файле /etc/mysql/my.cnf

2.1) Обязательно надо выполнить следующие настройки (в секцию mysqld):

* увеличиваем количество соединений
max_connections        = 100
* увеличиваем пулы для InnoDB
	**innodb_buffer_pool_size - рекомендуют делать около 75% RAM, но мы знаем что максимум можем отдать мускулу только 50%, поэтому считаем 75% от 50% и получаем
	innodb_buffer_pool_size = 3G
	** файл лога, сделайте для начала innodb_log_file_size=512M
	** innodb_thread_concurrency = 12


2.2)
Скачиваем специальный скрипт, который нам будет подсказывать правильно ли мы делаем настройку (https://launchpad.net/mysql-tuning-primer).

wget https://launchpad.net/mysql-tuning-primer/trunk/1.6-r1/+download/tuning-primer.sh

Делаем файл исполняемым
chmod a+x tuning-primer.sh 

Запускаем
./tuning-primer.sh 

Получаем вывод
warning, got bogus unix line.
warning, got bogus unix line.
warning, got bogus unix line.
warning, got bogus unix line.

Using login values from ~/.my.cnf
- INITIAL LOGIN ATTEMPT FAILED -
Testing for stored webmin passwords:
 None Found
Could not auto detect login info!
Found potential sockets: /var/run/mysqld/mysqld.sock
Using: /var/run/mysqld/mysqld.sock
Would you like to provide a different socket?: [y/N] 

Отвечаем N

Do you have your login handy ? [y/N]

Отвечаем  y.
Далее скрипт запросит логин и пароль для подключения к mysql
User: root
Password: root


И захочет создать файл настроек для того чтобы не спрашивать параметры подключения в следующий раз
Would you like me to create a ~/.my.cnf file for you? [y/N] :
Можно ответить ему y

Далее смотрим на вывод скрипта и корректируем настройки в соответствии с его рекомендациями и здравым смыслом.




Чтобы настройки вступили в силу надо перезапустить Mysql. При этом надо помнить, что mysql можно перезапускать только при потушенном Jboss-е.